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Estudos Linguísticos (DOUTORADO e MESTRADO)
Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas (Câmpus de São José do Rio Preto)

Estudos Literários (DOUTORADO e MESTRADO)
Faculdade de Ciências e Letras (Câmpus de Araraquara)

Farmacologia e Biotecnologia (DOUTORADO e MESTRADO)
Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas (Câmpus de São José do Rio Preto)
Instituto de Biociências (Câmpus de Botucatu)

Filosofia (DOUTORADO e MESTRADO)
Faculdade de Filosofia e Ciências (Câmpus de Marília)

Física (DOUTORADO e MESTRADO)
Instituto de Física Teórica (Unidade Complementar - São Paulo)

Física (DOUTORADO e MESTRADO)
Instituto de Geociências e Ciências Exatas (Câmpus de Rio Claro)

Física e Astronomia (DOUTORADO e MESTRADO)
Faculdade de Engenharia e Ciências (Câmpus de Guaratinguetá)

Fisiopatologia em Clínica Médica (DOUTORADO e MESTRADO)
Faculdade de Medicina (Câmpus de Botucatu)

Fisioterapia (DOUTORADO e MESTRADO)
Faculdade de Ciências e Tecnologia (Câmpus de Presidente Prudente)
Instituto de Biociências (Câmpus de Rio Claro)

Genética e Melhoramento Animal (DOUTORADO e MESTRADO)
Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias (Câmpus de Jaboticabal)

Programas de Pós-graduação