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Odontologia Restauradora (DOUTORADO e MESTRADO)
Instituto de Ciência e Tecnologia (Câmpus de São José dos Campos)
Patologia (DOUTORADO e MESTRADO)
Faculdade de Medicina (Câmpus de Botucatu)
Pesquisa Clínica (DOUTORADO PROFISSIONAL e MESTRADO PROFISSIONAL)
Faculdade de Medicina (Câmpus de Botucatu)
Centro de Estudos de Venenos e Animais Peçonhentos (Campus de Botucatu)
Pesquisa e Desenvolvimento (Biotecnologia Médica) (DOUTORADO PROFISSIONAL e MESTRADO PROFISSIONAL)
Faculdade de Medicina (Câmpus de Botucatu)
Planejamento e Análise de Políticas Públicas (MESTRADO PROFISSIONAL)
Faculdade de Ciências Humanas e Sociais (Câmpus de Franca)
Propriedade Intelectual e Transferência de Tecnologia para Inovação (PROFNIT) (MESTRADO PROFISSIONAL)
Faculdade de Ciências Agronômicas (Câmpus de Botucatu)
Psicologia (DOUTORADO e MESTRADO)
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Química (DOUTORADO e MESTRADO)
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Química (DOUTORADO e MESTRADO)
Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas (Câmpus de São José do Rio Preto)

Programas de Pós-graduação